Regulamento

América Futebol Clube (Acesso da Série C em 2005) - RN
Associação Portuguesa de Desportos - SP
Avaí Futebol Clube - SC
Brasiliense Futebol Clube (Decesso da Série A em 2005) - DF
Ceará Sporting Club - CE
Clube Atlético Mineiro (Decesso da Série A em 2005) - MG
Clube de Regatas Brasil (CRB) - AL
Clube do Remo (Acesso da Série C em 2005) - PA
Clube Náutico Capibaribe - PE
Coritiba Foot Ball Clube (Decesso da Série A em 2005) - PR
Esporte Clube Santo André - SP
Guarani Futebol Clube - SP
Ituano S/C de Futebol Ltda - SP
Marília Atlético Clube - SP
Paulista Futebol Clube - SP
Paysandú Sport Club (Decesso da Série A em 2005) - PA
São Raimundo Esporte Clube - AM
Sociedade Esportiva do Gama - DF
Sport Clube do Recife- PE
Vila Nova Futebol Clube - GO

O campeonato será disputado no sistema de pontos corridos, de forma contínua, em turno (jogos de ida) e returno (jogos de volta), sagrando-se campeão o clube que acumular o maior número de pontos ganhos em toda a disputa.

Em caso de empate em pontos ganhos entre dois ou mais clubes ao final da competição, o desempate, para efeito de classificação, será efetuado observando-se os critérios abaixo:
1º) maior número de vitórias;
2º) maior saldo de gols;
3º) maior número de gols pró;
4º) confronto direto (quando o empate ocorrer apenas entre dois clubes);
5°) menor número de cartões recebidos;
6º) sorteio.

Para efeito do quarto critério (confronto direto entre dois clubes) considera-se o resultado dos jogos de ida e volta somados, ou seja, o resultado do "jogo de 180 minutos". Permanecendo o empate, o desempate dar-se-á pelo maior número de gols assinalados no campo do adversário.

Para a aplicação do quinto critério (menor número de cartões recebidos) deverá ser considerado, inicialmente, o total de cartões vermelhos recebidos pelo clube na competição e, permanecendo o empate, o total de cartões amarelos.

Exclusivamente nos casos em que houver empate entre dois clubes nas situações de definição do título de campeão e de definição do decesso, em lugar do 6° item do caput deste artigo, o desempate ocorrerá através da realização de um jogo extra, entre os dois clubes, em campo neutro, a ser indicado pelo Departamento Técnico da CBF, e a ser disputado em até quatro dias após o encerramento do campeonato; havendo empate nesse jogo, a decisão ocorrerá através da disputa de pênaltis, observados os critérios adotados pela International Board.

Ao final da competição, os quatro primeiros clubes classificados da Série B/2006 ascenderão à Série A/2007, os quatros últimos clubes classificados da Série B/2006 descenderão para a Série C/2007; os quatros últimos classificados da Série A/2006 descenderão para a Série B/2007 e os quatros primeiros clubes classificados na Série C/2006 ascenderão a Série B/2007.